Нойр булчирхайн хорт хавдар нь таамаглал муутай дэлхийн хамгийн үхлийн хорт хавдрын нэг юм.Тиймээс нойр булчирхайн хорт хавдраар өвчлөх өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүдийг тодорхойлох, эмчилгээг тохируулах, эдгээр өвчтөнүүдийн тавиланг сайжруулахын тулд үнэн зөв таамаглах загвар хэрэгтэй.
Бид UCSC Xena мэдээллийн сангаас The Cancer Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) RNAseq мэдээллийг авч, корреляцийн шинжилгээгээр дархлаатай холбоотой lncRNAs (irlncRNAs)-ыг тодорхойлж, TCGA болон хэвийн нойр булчирхайн аденокарцинома эдүүдийн хоорондын ялгааг тодорхойлсон.DEirlncRNA) TCGA болон нойр булчирхайн эдийн генотипийн эдийн илэрхийлэл (GTEx).Урьдчилан таамаглах гарын үсгийн загварыг бий болгохын тулд цаашдын нэг хувьсагч ба лассо регрессийн шинжилгээг хийсэн.Дараа нь бид муруйн доорх талбайг тооцоолж, өндөр ба бага эрсдэлтэй нойр булчирхайн аденокарциноматай өвчтөнүүдийг тодорхойлох оновчтой захын утгыг тодорхойлсон.Нойр булчирхайн хорт хавдрын өндөр ба бага эрсдэлтэй өвчтөнүүдийн эмнэлзүйн шинж чанар, дархлааны эсийн нэвчилт, дархлаа дарангуйлах бичил орчин, химийн эмчилгээнд тэсвэртэй байдлыг харьцуулах.
Бид DEirlncRNA-ийн 20 хосыг тодорхойлж, хамгийн оновчтой хязгаарын утгын дагуу өвчтөнүүдийг бүлэглэсэн.Манай прогнозын гарын үсэг загвар нь PAAD-тай өвчтөнүүдийн таамаглалыг урьдчилан таамаглахад чухал ач холбогдолтой болохыг бид харуулсан.ROC муруйн AUC нь 1 жилийн таамаглалд 0.905, 2 жилийн таамаглалд 0.942, 3 жилийн таамаглалд 0.966 байна.Өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүдийн эсэн мэнд үлдэх хувь бага, эмнэлзүйн шинж чанар муу байв.Мөн өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүд дархлаа дарангуйлагдсан бөгөөд дархлааны эмчилгээнд тэсвэртэй болох боломжтой гэдгийг бид харуулсан.Паклитаксел, сорафениб, эрлотиниб зэрэг хорт хавдрын эсрэг эмийг тооцооллын таамаглалын хэрэгсэлд үндэслэн үнэлэх нь PAAD-тай өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүдэд тохиромжтой байж болно.
Ерөнхийдөө бидний судалгаагаар нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдэд прогнозын үнэ цэнийг харуулсан хосолсон irlncRNA дээр суурилсан эрсдэлийн шинэ загварыг бий болгосон.Манай эрсдэлийн прогнозын загвар нь эмчилгээний эмчилгээнд тохиромжтой PAAD-тай өвчтөнүүдийг ялгахад тусална.
Нойр булчирхайн хорт хавдар нь таван жил амьдрах чадвар багатай, өндөр зэрэгтэй хорт хавдар юм.Оношлогооны үед ихэнх өвчтөнүүд аль хэдийн ахисан шатанд байна.COVID-19-ийн тархалтын нөхцөлд нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдийг эмчлэхэд эмч, сувилагч нар асар их дарамт шахалтанд ордог бөгөөд өвчтөний ар гэрийнхэн эмчилгээний шийдвэр гаргахад олон дарамттай тулгардаг [1, 2].Неоадъювант эмчилгээ, мэс заслын мэс засал, туяа эмчилгээ, хими эмчилгээ, зорилтот молекул эмчилгээ, дархлааны хяналтын цэгийн дарангуйлагч (ICIs) гэх мэт DOAD-ийн эмчилгээнд томоохон ахиц дэвшил гарсан ч оношлогдсоноос хойш 5 жилийн дараа өвчтөнүүдийн дөнгөж 9 орчим хувь нь амьд үлддэг [3] ].], 4].Нойр булчирхайн аденокарциномын эхний шинж тэмдгүүд нь хэвийн бус байдаг тул өвчтөнүүд ихэвчлэн дэвшилтэт үе шатанд үсэрхийлсэн гэж оношлогддог [5].Тиймээс тухайн өвчтөнд хувь хүний цогц эмчилгээ хийх нь зөвхөн амьд үлдэх хугацааг уртасгах төдийгүй амьдралын чанарыг сайжруулах бүх эмчилгээний давуу болон сул талуудыг жинлэх ёстой [6].Тиймээс өвчтөний таамаглалыг үнэн зөв үнэлэхийн тулд үр дүнтэй таамаглах загвар шаардлагатай байдаг [7].Тиймээс PAAD-тай өвчтөнүүдийн эсэн мэнд үлдэх, амьдралын чанарыг тэнцвэржүүлэхийн тулд зохих эмчилгээг сонгох боломжтой.
PAAD-ийн таамаглал муу байгаа нь голчлон хими эмчилгээний эмэнд тэсвэртэй байдагтай холбоотой юм.Сүүлийн жилүүдэд дархлаа шалгах цэгийн дарангуйлагчдыг хатуу хавдрын эмчилгээнд өргөнөөр ашиглаж байна [8].Гэсэн хэдий ч нойр булчирхайн хорт хавдрын үед ICI-ийг ашиглах нь амжилтанд хүрэх нь ховор [9].Тиймээс ICI эмчилгээний үр шимийг хүртэх боломжтой өвчтөнүүдийг тодорхойлох нь чухал юм.
Урт кодчилдоггүй РНХ (lncRNA) нь 200-аас дээш нуклеотид бүхий транскрипт бүхий кодчилдоггүй РНХ-ийн төрөл юм.LncRNA нь өргөн тархсан бөгөөд хүний транскриптомын 80 орчим хувийг бүрдүүлдэг [10].lncRNA-д суурилсан прогнозын загварууд нь өвчтөний таамаглалыг үр дүнтэйгээр таамаглаж чаддаг болохыг олон тооны ажил харуулсан [11, 12].Жишээлбэл, аутофагитай холбоотой 18 lncRNA-г илрүүлж, хөхний хорт хавдрын прогнозын гарын үсэг зурсан [13].Дархлаатай холбоотой өөр зургаан lncRNA-г глиомагийн прогнозын шинж чанарыг тогтооход ашигласан [14].
Нойр булчирхайн хорт хавдрын үед зарим судалгаагаар өвчтөний таамаглалыг урьдчилан таамаглах зорилгоор lncRNA-д суурилсан гарын үсэг зурсан байдаг.ROC муруйн доорх талбай (AUC) ердөө 0.742, нийт 3 жил амьд үлдэх (OS) бүхий нойр булчирхайн аденокарциномад 3-lncRNA-ийн тэмдэг тогтоогдсон [15].Нэмж дурдахад lncRNA-ийн илэрхийлэлийн утга нь өөр өөр геном, өөр өөр өгөгдлийн формат, өөр өөр өвчтөнүүдийн хооронд өөр өөр байдаг бөгөөд урьдчилан таамаглах загварын гүйцэтгэл тогтворгүй байдаг.Тиймээс бид илүү нарийвчлалтай, тогтвортой урьдчилан таамаглах загварыг бий болгохын тулд дархлаатай холбоотой lncRNA (irlncRNA) гарын үсгийг үүсгэхийн тулд шинэ загварчлалын алгоритм, хослох, давталтыг ашигладаг [8].
Нормалжуулсан RNAseq өгөгдөл (FPKM) болон нойр булчирхайн хорт хавдрын эмнэлзүйн TCGA болон генотипийн эдийн илэрхийлэл (GTEx) мэдээллийг UCSC XENA мэдээллийн сангаас ( https://xenabrowser.net/datapages/ ) авсан.GTF файлуудыг Ensembl мэдээллийн сангаас ( http://asia.ensembl.org ) авч, RNAseq-аас lncRNA илэрхийллийн профайлыг задлахад ашигласан.Бид ImmPort мэдээллийн сангаас (http://www.immport.org) дархлаатай холбоотой генүүдийг татаж авч, корреляцийн шинжилгээг ашиглан дархлаатай холбоотой lncRNA-уудыг (irlncRNAs) тодорхойлсон (p <0.001, r> 0.4).TCGA-PAAD когорт (|logFC| > 1 ба GEPIA2 мэдээллийн сангаас (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) олж авсан irlncRNAs болон дифференциалаар илэрхийлэгдсэн lncRNAs-ийг гатлах замаар дифференциал илэрхийлэгдсэн irlncRNAs (DEirlncRNAs)-ийг тодорхойлох. ) <0.05).
Энэ аргыг өмнө нь мэдээлсэн [8].Тодруулбал, бид хосолсон lncRNA A ба lncRNA B-ийг орлуулахын тулд X-г бүтээдэг. lncRNA A-ийн илэрхийлэлийн утга нь lncRNA B-ийн илэрхийлэлийн утгаас их байвал X-г 1, өөрөөр бол X-г 0 гэж тодорхойлно. Тиймээс бид олж авч болно. 0 эсвэл – 1 гэсэн матриц. Матрицын босоо тэнхлэг нь дээж бүрийг, хэвтээ тэнхлэг нь 0 эсвэл 1 гэсэн утгатай DEirlncRNA хос бүрийг илэрхийлнэ.
Нэг хувьсах регрессийн шинжилгээ, дараа нь Лассо регрессийг прогнозын DEirlncRNA хосыг илрүүлэхэд ашигласан.Лассо регрессийн шинжилгээнд 1000 удаа давтагдсан 10 дахин хөндлөн баталгаажуулалтыг ашигласан (p <0.05), нэг гүйлтэд 1000 санамсаргүй өдөөгчтэй.DEirlncRNA хос бүрийн давтамж 1000 мөчлөгт 100 дахин давсан үед DEirlncRNA хосуудыг прогнозын эрсдэлийн загвар бүтээхээр сонгосон.Дараа нь бид AUC муруйг ашиглан PAAD-тай өвчтөнүүдийг өндөр ба бага эрсдэлтэй бүлэгт ангилах оновчтой хязгаарын утгыг олов.Загвар бүрийн AUC утгыг мөн тооцоолж, муруй хэлбэрээр зурсан.Хэрэв муруй нь AUC-ийн хамгийн их утгыг харуулсан хамгийн дээд цэгт хүрвэл тооцоолох үйл явц зогсч, загварыг хамгийн сайн нэр дэвшигч гэж үзнэ.1, 3, 5 жилийн ROC муруйн загваруудыг бүтээсэн.Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загварын бие даасан урьдчилан таамаглах гүйцэтгэлийг шалгахын тулд нэг хувьсах болон олон хувьсах регрессийн шинжилгээг ашигласан.
XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, CIBERSORT зэрэг дархлааны эсийн нэвчилтийг судлах долоон хэрэгслийг ашигла.Дархлааны эсийн нэвчилтийн мэдээллийг TIMER2 мэдээллийн сангаас (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3) татаж авсан.Бүтээсэн загварын өндөр ба бага эрсдэлтэй бүлгүүдийн хоорондох дархлааны нэвчдэст эсийн агууламжийн ялгааг Вилкоксон тэмдэгт зэрэглэлийн тест ашиглан шинжилж, үр дүнг квадрат графикаар харуулав.Эрсдлийн оноо болон дархлааны нэвчдэст эсүүдийн хоорондын хамаарлыг шинжлэхийн тулд Спирманы корреляцийн шинжилгээг хийсэн.Үүссэн корреляцийн коэффициентийг чихэрлэг хэлбэрээр үзүүлэв.Ач холбогдолын босгыг p<0.05 гэж тогтоосон.Уг процедурыг R багц ggplot2 ашиглан гүйцэтгэсэн.Дархлааны эсийн нэвчилттэй холбоотой загвар болон генийн илэрхийлэлийн түвшин хоорондын хамаарлыг судлахын тулд бид ggstatsplot багц болон хийлийн график дүрслэлийг гүйцэтгэсэн.
Нойр булчирхайн хорт хавдрын эмнэлзүйн эмчилгээний хэв маягийг үнэлэхийн тулд бид TCGA-PAAD бүлэгт түгээмэл хэрэглэгддэг хими эмчилгээний эмийн IC50-ийг тооцоолсон.Өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгүүдийн хагас дарангуйлах концентрацийн (IC50) ялгааг Wilcoxon signed-rank test ашиглан харьцуулсан бөгөөд үр дүнг R-д pRRophetic болон ggplot2 ашиглан үүсгэсэн хайрцагны график хэлбэрээр үзүүлэв. Бүх аргууд нь холбогдох заавар, нормтой нийцдэг.
Бидний судалгааны ажлын явцыг Зураг 1-д үзүүлэв. lncRNA болон дархлаатай холбоотой генүүдийн хоорондын хамаарлын шинжилгээг ашиглан бид p<0.01 ба r>0.4-тэй 724 irlncRNA-г сонгосон.Дараа нь бид GEPIA2-ийн дифференциалаар илэрхийлэгдсэн lncRNA-д дүн шинжилгээ хийсэн (Зураг 2А).Нийт 223 irlncRNA-г нойр булчирхайн аденокарцинома болон нойр булчирхайн хэвийн эд (|logFC| > 1, FDR < 0.05) хооронд DEirlncRNAs гэж нэрлэв.
Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загварыг бий болгох.(A) Дифференциалаар илэрхийлэгдсэн lncRNA-уудын галт уулын зураг.(B) 20 DEirlncRNA хосын лассо коэффициентийн тархалт.(C) LASSO коэффициентийн тархалтын хэсэгчилсэн магадлалын хэлбэлзэл.(D) 20 DEirlncRNA хосын нэг хувьсах регрессийн шинжилгээг харуулсан ойн график.
Дараа нь бид 223 DEirlncRNA-г хослуулан 0 эсвэл 1 матрицыг бүтээсэн.Нийт 13,687 DEirlncRNA хосыг тодорхойлсон.Нэг хувьсагч ба лассо регрессийн шинжилгээний дараа 20 DEirlncRNA хосыг эцэст нь эрсдэлийн прогнозын загвар бүтээхээр туршсан (Зураг 2B-D).Lasso болон олон регрессийн шинжилгээний үр дүнд үндэслэн бид TCGA-PAAD когорт дахь өвчтөн бүрийн эрсдэлийн оноог тооцоолсон (Хүснэгт 1).Ласогийн регрессийн шинжилгээний үр дүнд үндэслэн бид TCGA-PAAD когорт дахь өвчтөн бүрийн эрсдэлийн оноог тооцоолсон.ROC муруйн AUC нь 1 жилийн эрсдэлийн загварын таамаглалд 0.905, 2 жилийн таамаглалд 0.942, 3 жилийн таамаглалд 0.966 байв (Зураг 3A-B).Бид 3.105-ийн оновчтой хязгаарын утгыг тогтоож, TCGA-PAAD когортын өвчтөнүүдийг өндөр ба бага эрсдэлтэй бүлэгт ангилж, өвчтөн бүрийн эсэн мэнд үлдэх үр дүн болон эрсдэлийн онооны хуваарилалтыг зурсан (Зураг 3C-E).Каплан-Мейерийн шинжилгээгээр өндөр эрсдэлтэй бүлгийн PAAD-тай өвчтөнүүдийн эсэн мэнд амьдрах чадвар бага эрсдэлтэй бүлгийн өвчтөнүүдийнхээс (p <0.001) хамаагүй бага байгааг харуулсан (Зураг 3F).
Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загваруудын хүчинтэй байдал.(A) Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загварын ROC.(B) 1, 2, 3 жилийн ROC прогнозын эрсдэлийн загварууд.(C) Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загварын ROC.Хамгийн оновчтой таслах цэгийг харуулна.(DE) Амьд үлдэх байдал (D) болон эрсдэлийн оноо (E) -ийн хуваарилалт.(F) Өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгийн PAAD өвчтөнүүдийн Каплан-Мейерийн шинжилгээ.
Бид эрсдэлийн онооны ялгааг эмнэлзүйн шинж чанараар нь цаашид үнэлэв.Туузан зураг (Зураг 4А) нь эмнэлзүйн шинж чанар болон эрсдэлийн онооны хоорондох ерөнхий хамаарлыг харуулж байна.Ялангуяа өндөр настай өвчтөнүүд эрсдэлийн оноо илүү өндөр байсан (Зураг 4B).Түүнчлэн II үе шаттай өвчтөнүүд I үе шаттай өвчтөнүүдээс илүү эрсдэлтэй оноотой байсан (Зураг 4C).PAAD-тай өвчтөнүүдийн хавдрын зэрэглэлийн тухайд 3-р зэргийн өвчтөнүүд 1 ба 2-р зэрэгтэй өвчтөнүүдээс өндөр эрсдэлтэй байсан (Зураг 4D).Бид цаашид нэг болон олон хувьсах регрессийн шинжилгээ хийж, эрсдэлийн оноо (p <0.001) болон нас (p = 0.045) нь PAAD-тай өвчтөнүүдийн бие даасан прогнозын хүчин зүйл болохыг харуулсан (Зураг 5A-B).ROC муруй нь эрсдэлийн оноо нь PAAD-тай өвчтөнүүдийн 1, 2, 3 жилийн эсэн мэнд үлдэхийг урьдчилан таамаглахад бусад эмнэлзүйн шинж чанаруудаас давуу болохыг харуулсан (Зураг 5C-E).
Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загваруудын клиник шинж чанарууд.Гистограмм (A) нь (B) нас, (C) хавдрын үе шат, (D) хавдрын зэрэг, эрсдлийн оноо, TCGA-PAAD когорт дахь өвчтөнүүдийн хүйсийг харуулдаг.**p <0.01
Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загваруудын бие даасан урьдчилсан дүн шинжилгээ.(AB) Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загвар болон эмнэлзүйн шинж чанаруудын нэг хувьсагч (A) ба олон хувьсагч (B) регрессийн шинжилгээ.(CE) Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загвар, эмнэлзүйн шинж чанарын хувьд 1, 2, 3 жилийн ROC
Тиймээс бид цаг хугацаа болон эрсдэлийн онооны хамаарлыг судалсан.PAAD өвчтөнүүдийн эрсдэлийн оноо нь CD8+ T эсүүд болон NK эсүүдтэй урвуу хамааралтай болохыг олж мэдсэн (Зураг 6А) нь эрсдэл өндөртэй бүлгийн дархлаа дарангуйлагдсан байгааг харуулж байна.Бид мөн өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгүүдийн дархлааны эсийн нэвчилтийн ялгааг үнэлж, ижил үр дүнг олсон (Зураг 7).Өндөр эрсдэлтэй бүлэгт CD8+ Т эс болон NK эсийн нэвчдэс бага байсан.Сүүлийн жилүүдэд дархлааны хяналтын цэгийн дарангуйлагч (ICIs) нь хатуу хавдрыг эмчлэхэд өргөн хэрэглэгддэг.Гэсэн хэдий ч нойр булчирхайн хорт хавдрын үед ICI-ийг ашиглах нь амжилтанд хүрэх нь ховор байдаг.Тиймээс бид өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгийн дархлааны хяналтын цэгийн генийн илэрхийлэлийг үнэлэв.Эрсдэл багатай бүлэгт CTLA-4 ба CD161 (KLRB1) хэт ихэссэнийг бид олж мэдсэн (Зураг 6B-G) нь эрсдэл багатай бүлгийн PAAD өвчтөнүүд ICI-д мэдрэмтгий байж болохыг харуулж байна.
Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загвар ба дархлааны эсийн нэвчилтийн хамаарлын шинжилгээ.(A) Урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загвар ба дархлааны эсийн нэвчилт хоорондын хамаарал.(BG) Өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлэгт генийн илэрхийлэлийг заана.(HK) Өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгийн хорт хавдрын эсрэг тусгай эмийн IC50 утгууд.*p <0.05, **p <0.01, ns = чухал биш
Бид TCGA-PAAD когорт дахь эрсдэлийн оноо болон нийтлэг хими эмчилгээний бодисуудын хоорондын хамаарлыг цаашид үнэлэв.Бид нойр булчирхайн хорт хавдрын үед түгээмэл хэрэглэгддэг хорт хавдрын эсрэг эмүүдийг хайж, өндөр болон бага эрсдэлтэй бүлгүүдийн IC50 утгын ялгааг шинжилсэн.Үр дүн нь AZD.2281 (олапариб)-ын IC50 утга өндөр эрсдэлтэй бүлэгт илүү өндөр байсан нь өндөр эрсдэлтэй бүлгийн PAAD өвчтөнүүд AZD.2281 эмчилгээнд тэсвэртэй байж болохыг харуулж байна (Зураг 6H).Нэмж дурдахад паклитаксел, сорафениб, эрлотиниб зэрэг IC50-ийн утга өндөр эрсдэлтэй бүлэгт бага байсан (Зураг 6I-K).Бид өндөр эрсдэлтэй бүлэгт IC50-ийн утга өндөртэй хорт хавдрын эсрэг 34 эм, өндөр эрсдэлтэй бүлэгт IC50-ийн утга багатай 34 хорт хавдрын эсрэг эмийг тодорхойлсон (Хүснэгт 2).
lncRNAs, mRNAs, miRNAs нь өргөн тархсан бөгөөд хорт хавдрын хөгжилд чухал үүрэг гүйцэтгэдэг гэдгийг үгүйсгэх аргагүй юм.Хэд хэдэн төрлийн хорт хавдрын үед нийт эсэн мэнд үлдэхийг урьдчилан таамаглахад мРНХ эсвэл миРНХ чухал үүрэг гүйцэтгэдэг болохыг батлах хангалттай нотолгоо байдаг.Эрсдлийн олон прогнозын загварууд нь lncRNA дээр суурилдаг нь эргэлзээгүй.Жишээлбэл, Луо нар.Судалгаанаас харахад LINC01094 нь PC-ийн тархалт, үсэрхийлэлд гол үүрэг гүйцэтгэдэг бөгөөд LINC01094-ийн өндөр илэрхийлэл нь нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдийн амьд үлдэх чадвар муу байгааг харуулж байна [16].Лин нар танилцуулсан судалгаа.Судалгаанаас үзэхэд lncRNA FLVCR1-AS1-ийн зохицуулалт буурах нь нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдэд таамаглал муутай холбоотой байдаг [17].Гэсэн хэдий ч дархлаатай холбоотой lncRNAs нь хорт хавдартай өвчтөнүүдийн нийт эсэн мэнд үлдэхийг урьдчилан таамаглах үүднээс харьцангуй бага яригддаг.Сүүлийн үед хорт хавдартай өвчтөнүүдийн эсэн мэнд үлдэхийг урьдчилан таамаглах, улмаар эмчилгээний аргуудыг тохируулах эрсдэлийн прогнозын загваруудыг бий болгоход ихээхэн хэмжээний ажил чиглэгдэж байна [18, 19, 20].Хорт хавдар үүсэх, даамжрах, хими эмчилгээ зэрэг эмчилгээнд хариу үйлдэл үзүүлэхэд дархлааны нэвчдэс чухал үүрэг гүйцэтгэдэг болохыг улам бүр хүлээн зөвшөөрч байна.Хавдрын нэвчдэст дархлааны эсүүд цитотоксик хими эмчилгээний хариу урвалд чухал үүрэг гүйцэтгэдэг болохыг олон тооны судалгаагаар баталсан [21, 22, 23].Хавдрын дархлааны бичил орчин нь хавдартай өвчтөнүүдийн амьд үлдэх чухал хүчин зүйл юм [24, 25].Дархлаа эмчилгээ, ялангуяа ICI эмчилгээ нь хатуу хавдрын эмчилгээнд өргөн хэрэглэгддэг [26].Дархлаатай холбоотой генийг прогнозын эрсдэлийн загварыг бий болгоход өргөн ашигладаг.Жишээ нь, Su et al.Дархлаатай холбоотой прогнозын эрсдэлийн загвар нь өндгөвчний хорт хавдартай өвчтөнүүдийн таамаглалыг урьдчилан таамаглахын тулд уураг кодлогч ген дээр суурилдаг [27].lncRNA гэх мэт кодчилдоггүй генүүд нь прогнозын эрсдэлийн загварыг бий болгоход тохиромжтой [28, 29, 30].Луо нар дархлаатай холбоотой дөрвөн lncRNA-г туршиж, умайн хүзүүний хорт хавдрын эрсдлийг урьдчилан таамаглах загварыг бий болгосон [31].Хан нар.Нийт 32 ялгавартай илэрхийлэгдсэн транскриптийг тодорхойлсон бөгөөд үүнд үндэслэн 5 чухал транскрипт бүхий урьдчилан таамаглах загварыг бий болгосон бөгөөд энэ нь бөөр шилжүүлэн суулгасны дараа биопсигоор батлагдсан цочмог татгалзлыг урьдчилан таамаглахад маш их зөвлөдөг хэрэгсэл болгон санал болгосон [32].
Эдгээр загваруудын ихэнх нь уураг кодлогч ген эсвэл кодлогддоггүй генийн генийн илэрхийлэлийн түвшинд суурилдаг.Гэсэн хэдий ч ижил ген нь өөр өөр геном, мэдээллийн формат, өөр өөр өвчтөнүүдэд өөр өөр экспрессийн утгатай байж болох бөгөөд энэ нь урьдчилан таамаглах загварт тогтворгүй тооцоололд хүргэдэг.Энэ судалгаанд бид яг илэрхийллийн утгаас үл хамааран хоёр хос lncRNA-тай боломжийн загварыг бүтээсэн.
Энэ судалгаанд бид дархлаатай холбоотой генүүдтэй корреляцийн шинжилгээ хийх замаар анх удаа irlncRNA-г тодорхойлсон.Бид 223 DEirlncRNA-г дифференциалаар илэрхийлэгдсэн lncRNA-тай эрлийзжүүлэх замаар шалгасан.Хоёрдугаарт, бид нийтлэгдсэн DEirlncRNA хослох арга [31] дээр үндэслэн 0-эсвэл-1 матрицыг бүтээсэн.Дараа нь бид прогнозын DEirlncRNA хосуудыг тодорхойлж, урьдчилан таамаглах эрсдэлийн загварыг бий болгохын тулд нэг хувьсагч болон лассо регрессийн шинжилгээ хийсэн.Бид цаашлаад PAAD-тай өвчтөнүүдийн эрсдэлийн оноо болон эмнэлзүйн шинж чанаруудын хоорондын хамааралд дүн шинжилгээ хийсэн.Манай прогнозын эрсдэлийн загвар нь PAAD-тай өвчтөнүүдийн бие даасан прогнозын хүчин зүйл болохын хувьд өндөр зэрэглэлийн өвчтөнүүдийг бага зэрэгтэй өвчтөнүүдээс, өндөр зэрэгтэй өвчтөнүүдийг бага зэрэгтэй өвчтөнүүдээс үр дүнтэй ялгаж чаддаг болохыг олж мэдсэн.Түүнчлэн прогнозын эрсдэлийн загварын ROC муруйн AUC утга нь 1 жилийн таамаглалд 0.905, 2 жилийн таамаглалд 0.942, 3 жилийн таамаглалд 0.966 байна.
Судлаачид CD8+ Т эсийн нэвчдэс ихтэй өвчтөнүүд ICI эмчилгээнд илүү мэдрэмтгий байдаг гэж мэдээлсэн [33].Хавдрын дархлааны бичил орчин дахь цитотоксик эсүүд, CD56 NK эсүүд, NK эсүүд болон CD8+ Т эсийн агууламж нэмэгдэж байгаа нь хавдрыг дарах нөлөөний нэг шалтгаан байж болно [34].Өмнөх судалгаанууд нь хавдрын нэвчдэст CD4(+) T ба CD8(+) T-ийн өндөр түвшин нь урт наслахад ихээхэн хамааралтай болохыг харуулсан [35].CD8 Т эсийн нэвчилт муу, неоантигений ачаалал бага, хавдрын өндөр дархлаа дарангуйлах бичил орчин зэрэг нь ICI эмчилгээнд хариу өгөхгүй байхад хүргэдэг [36].Эрсдлийн оноо нь CD8+ T эсүүд болон NK эсүүдтэй сөрөг хамааралтай болохыг бид олж мэдсэн нь өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүд ICI эмчилгээнд тохиромжгүй, таамаглал нь муу байгааг харуулж байна.
CD161 нь байгалийн алуурчин (NK) эсийн маркер юм.CD8+CD161+ CAR-аар хөрвүүлсэн Т эсүүд нь HER2+ нойр булчирхайн сувгийн аденокарцинома ксенокарцинома [37] загварт in vivo хавдрын эсрэг үр нөлөөг сайжруулдаг.Дархлаа шалгах цэгийн дарангуйлагчид нь цитотоксик Т-лимфоциттой холбоотой уураг 4 (CTLA-4) болон програмчлагдсан эсийн үхлийн уураг 1 (PD-1)/программчлагдсан эсийн үхлийн лиганд 1 (PD-L1) замуудыг чиглүүлдэг бөгөөд олон салбарт асар их боломжтой.CTLA-4 ба CD161 (KLRB1)-ийн илэрхийлэл өндөр эрсдэлтэй бүлгүүдэд бага байдаг нь өндөр эрсдэлтэй оноотой өвчтөнүүд ICI эмчилгээнд хамрагдах боломжгүй болохыг харуулж байна.[38]
Өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүдэд тохирох эмчилгээний хувилбаруудыг олохын тулд бид янз бүрийн хорт хавдрын эсрэг эмүүдэд дүн шинжилгээ хийж, PAAD-тай өвчтөнүүдэд өргөн хэрэглэгддэг паклитаксел, сорафениб, эрлотиниб нь PAAD-тай өндөр эрсдэлтэй өвчтөнүүдэд тохиромжтой болохыг олж мэдсэн.[33].Zhang нар ДНХ-ийн гэмтлийн хариу урвалын (DDR) аливаа зам дахь мутаци нь түрүү булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдэд таамаглал муутай болохыг олж мэдсэн [39].Нойр булчирхайн хорт хавдрын Olaparib Congoing (POLO) туршилт нь нойр булчирхайн сувгийн аденокарцинома болон үр хөврөлийн BRCA1/2 мутацитай өвчтөнүүдэд олапарибын эмчилгээ нь платинумд суурилсан хими эмчилгээ хийсний дараа плацеботой харьцуулахад удаан үргэлжлэхийг харуулсан.Энэ нь өвчтөнүүдийн энэ дэд бүлгийн эмчилгээний үр дүн мэдэгдэхүйц сайжирна гэсэн өөдрөг үзлийг бий болгодог.Энэхүү судалгаагаар AZD.2281 (олапариб)-ийн IC50 утга нь өндөр эрсдэлтэй бүлэгт илүү өндөр байсан нь өндөр эрсдэлтэй бүлгийн PAAD-тай өвчтөнүүд AZD.2281-ийн эмчилгээнд тэсвэртэй байж болохыг харуулж байна.
Энэ судалгаанд байгаа таамаглалын загварууд нь сайн таамаглах үр дүнг гаргадаг боловч тэдгээр нь аналитик таамаглал дээр суурилдаг.Эдгээр үр дүнг эмнэлзүйн мэдээллээр хэрхэн баталгаажуулах вэ гэдэг чухал асуулт юм.Дурангийн нарийн зүү аспирацийн хэт авиан шинжилгээ (EUS-FNA) нь нойр булчирхайн хатуу ба гаднах нойр булчирхайн гэмтлийг 85%-ийн мэдрэмжтэй, 98%-ийн өвөрмөц онцлогтой оношлох зайлшгүй арга болсон [41].EUS нарийн зүү бүхий биопси (EUS-FNB) зүү бий болсон нь голчлон оношилгооны өндөр нарийвчлал, гистологийн бүтцийг хадгалсан дээж авах, улмаар тодорхой онош тавихад чухал ач холбогдолтой дархлааны эдийг бий болгох гэх мэт FNA-тай харьцуулахад давуу тал дээр суурилдаг.тусгай будалт [42].Утга зохиолыг системтэй судалж үзэхэд FNB зүү (ялангуяа 22G) нь нойр булчирхайн массаас эдийг цуглуулах хамгийн үр дүнтэй болохыг баталжээ [43].Эмнэлзүйн хувьд зөвхөн цөөн тооны өвчтөнд радикал мэс засал хийх боломжтой байдаг бөгөөд ихэнх өвчтөнүүд эхний оношлох үед мэс засал хийх боломжгүй хавдартай байдаг.Эмнэлзүйн практикт өвчтөнүүдийн цөөхөн хэсэг нь радикал мэс засал хийхэд тохиромжтой байдаг, учир нь ихэнх өвчтөнүүд анхан шатны оношилгооны үед мэс засал хийх боломжгүй хавдартай байдаг.EUS-FNB болон бусад аргуудаар эмгэгийг баталгаажуулсны дараа хими эмчилгээ гэх мэт стандартчилсан мэс заслын бус эмчилгээг ихэвчлэн сонгодог.Бидний дараагийн судалгааны хөтөлбөр бол энэ судалгааны прогнозын загварыг мэс заслын болон мэс заслын бус бүлэгт ретроспектив шинжилгээгээр турших явдал юм.
Ерөнхийдөө бидний судалгаагаар нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдэд прогнозын үнэ цэнийг харуулсан хосолсон irlncRNA дээр суурилсан эрсдэлийн шинэ загварыг бий болгосон.Манай эрсдэлийн прогнозын загвар нь эмчилгээний эмчилгээнд тохиромжтой PAAD-тай өвчтөнүүдийг ялгахад тусална.
Одоогийн судалгаанд ашигласан, дүн шинжилгээ хийсэн мэдээллийн багцыг зохих хүсэлтийн дагуу холбогдох зохиогчоос авах боломжтой.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. COVID-19 тахлын үеийн сөрөг сэтгэл хөдлөлийг сэтгэл хөдлөлийн зохицуулахад өөрийгөө үр дүнтэй болгох зуучлах үүрэг: хөндлөн огтлолын судалгаа.Int J Ment Health Nurs [сэтгүүлийн нийтлэл].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Суй Вэн, Гонг Х, Цяо Х, Жан Л, Чен Ж, Дун Ж, нар.Эрчимт эмчилгээний тасагт өөр шийдвэр гаргах талаар гэр бүлийн гишүүдийн үзэл бодол: системчилсэн тойм.INT J NURS STUD [сэтгүүлийн нийтлэл;тойм].2023 01/01/2023;137:104391.
Винсент A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Нойр булчирхайн хорт хавдар.Лансет.[Сэтгүүлийн нийтлэл;судалгааны дэмжлэг, NIH, гадуурх;судалгааны дэмжлэг, АНУ-аас гадна засгийн газар;тойм].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Нойр булчирхайн хорт хавдрын тархвар судлал.Дэлхийн Гастроэнтерологийн сэтгүүл.[Сэтгүүлийн нийтлэл, тойм].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдийн нийт амьд үлдэхийг урьдчилан таамаглах шинэ tp53-тэй холбоотой номограмм.BMC хорт хавдар [сэтгүүлийн нийтлэл].2021 оны 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Хими эмчилгээ хийлгэж буй бүдүүн гэдэсний хорт хавдартай өвчтөнүүдийн хорт хавдартай холбоотой ядаргаанд шийдэлд чиглэсэн эмчилгээний үр нөлөө: санамсаргүй хяналттай туршилт.Хорт хавдрын сувилагч.[Сэтгүүлийн нийтлэл;санамсаргүй хяналттай туршилт;судалгааг АНУ-аас гадуурх засгийн газар дэмжиж байна].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Жан Чен, Жэн Вэн, Лу Ы, Шан Л, Шү Дун, Пан Ы, нар.Хагалгааны дараах хорт хавдрын эсрэгтөрөгчийн (CEA) түвшин нь мэс заслын өмнөх хэвийн CEA түвшинтэй өвчтөнүүдэд бүдүүн гэдэсний хорт хавдрын тайралт хийсний дараа үр дүнг урьдчилан таамаглаж байна.Орчуулгын хорт хавдар судлалын төв.[Сэтгүүлийн нийтлэл].2020 2020.01.01;9(1):111–8.
Хун Вэн, Лян Ли, Гу Ю, Ци Зи, Цю Хуа, Ян Х, нар.Дархлаатай холбоотой lncRNA нь шинэ шинж тэмдгүүдийг бий болгож, хүний элэгний эсийн хорт хавдрын дархлааг урьдчилан таамаглаж байна.Мол Ther Nucleic acids [Сэтгүүлийн нийтлэл].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Нойр булчирхайн хорт хавдрын дархлаа эмчилгээ: саад бэрхшээл ба нээлт.Анн ходоод гэдэсний мэс засалч [Сэтгүүлийн нийтлэл;тойм].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Халл R, Mbita Z, Dlamini Z. Урт кодчилдоггүй РНХ (LncRNAs), вирусын хавдрын геномик ба гажуудсан залгаасууд: эмчилгээний үр нөлөө.AM J CANCER RES [сэтгүүлийн нийтлэл;тойм].2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Ван Ж, Чен П, Жан Ю, Дин Ж, Ян Ю, Ли Х. 11-Эндометрийн хорт хавдрын прогнозтой холбоотой lncRNA гарын үсгийг тодорхойлох.Шинжлэх ухааны ололт амжилт [сэтгүүлийн нийтлэл].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Зян С, Рэн Х, Лю С, Лу З, Сю А, Цин С, нар.Бөөрний папилляр эсийн хорт хавдрын үед РНХ холбогч уургийн прогнозын ген ба эмийн нэр дэвшигчдийн цогц шинжилгээ.преген.[Сэтгүүлийн нийтлэл].2021.01.20.2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, нар.Аутофагитай холбоотой урт кодчилдоггүй РНХ-ийн шинж чанар нь хөхний хорт хавдрын урьдчилсан таамаглалыг урьдчилан таамаглаж байна.преген.[Сэтгүүлийн нийтлэл].2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Дархлаатай холбоотой зургаан lncRNA гарын үсэг нь glioblastoma multiforme-ийн таамаглалыг сайжруулдаг.MOL нейробиологи.[Сэтгүүлийн нийтлэл].2018 2018.05.01;55(5):3684–97.
Ву Б, Ван К, Фэй Ж, Бао Ю, Ван Х, Сүн З, нар.Шинэ tri-lncRNA гарын үсэг нь нойр булчирхайн хорт хавдартай өвчтөнүүдийн амьд үлдэхийг урьдчилан таамаглаж байна.ОНКОЛЫН ТӨЛӨӨЛӨГЧИД.[Сэтгүүлийн нийтлэл].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 нь хөвөн miR-577-ээр дамжин LIN28B илэрхийлэл болон PI3K/AKT замыг зохицуулах замаар нойр булчирхайн хорт хавдрын явцыг дэмждэг.Мол эмчилгээ - Нуклейн хүчил.2021;26:523–35.
Лин Ж, Жай X, Зоу С, Шү З, Жан Ж, Зян Л, нар.lncRNA FLVCR1-AS1 ба KLF10-ийн хоорондох эерэг санал хүсэлт нь PTEN/AKT замаар нойр булчирхайн хорт хавдрын явцыг саатуулдаг.J EXP Clin Хорт хавдрын эмч.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Элэгний эсийн хорт хавдрын нийт амьд үлдэхийг урьдчилан таамагласан арван гурван генийг тодорхойлох.Biosci Rep [сэтгүүлийн нийтлэл].2021.04.09.2021.
Шуудангийн цаг: 2023 оны 9-р сарын 22